答：《国务院关于印发个人所得税专项附加扣除暂行办法的通知》(国发[2018]41 号)第十一条规定，在一个纳税年度内，纳税人发生的与基本医保相关的医药费用支出，扣除医保报销后个人负担(指医保目录范围内的自付部分)累计超过 15000 元的部分，由纳税人在办理年度汇算清缴时，在 80000 元限额内据实扣除。
国家税务总局 2019 年 1 月 19 日发布的《个人所得税专项附加扣除 200 问》对第 42 个问题“大病医疗支出中，纳税人年末住院，第二年年初出院，这种跨年度的医疗费用，如何计算扣除额?是分两个年度分别扣除吗?”的解答明确，纳税人年末住院，第二年年初出院，一般是在出院时才进行医疗费用的结算。纳税人申报享受大病医疗扣除，以医疗费用结算单上的结算时间为准.
因此该医疗支出属于是第二年的医疗费用，到 2020 年结束时，如果达到大病医疗扣除的“起付线”，可以在 2020 年汇算清缴时享受扣除。
你公司该员工取得的医疗费用结算单上的结算时间为 2021 年因此应在 2021 年度个人所得税汇算清缴时，对扣除医保报销后个人负担累计超过 15000 元的部分，在 80000 元限额内据实扣除，假如该员工 2021 年度不再发生其他医疗支出，应税前扣除金额为 60000-15000=45000(元)。