答：《国家税务总局关于小规模纳税人免征增值税等征收管理事项的公告》(2022年第6号)明确，增值税小规模纳税人适用3%征收率应税销售收入免征增值税的，应按规定开具免税普通发票。
因此，你公司属于小规模纳税人，取得销售货物收入适用3%的征收率，符合免征增值税的条件，若你公司享受免税政策，应当开具免税普通发票。你公司升级增值税发票开票软件后，在开具普通发票时，“税率”栏次选择“免税”，不选择3%、1%、0等征收率。