盈余公积转增资本的，个人股东需要缴纳“股息红利所得”项目的个人所得税，境内法人股东不需要缴纳企业所得税，境外非居民企业需要缴纳企业所得税。
盈余公积转增资本后，股东再做股权转让的，就需要注意股权的计税基础变化。在转增过程中已经缴纳了所得税的（包括个人所得税和境外非居民企业的企业所得税），应依法增加股权成本（计税基础），而没有缴纳企业所得税的境内法人股东则不能增加股权成本（计税基础）。
不管在转增过程中需要是否需要缴纳所得税，都需要注意股权成本与股权数量的变化，如果只是部分转让股权，应按照“加权平均法”确定其股权原值。
因此，盈余公积转增资本后，再转让股权的，税务风险主要就是不能准确计算股权成本（原值）。