如果更改以前年度的企业所得税汇算申报表，是时间在纳税年度次年的5月31日后的，比如你说的两年前的，更改导致补税的，需要从滞纳之日开始计算滞纳金，每日万分之五。如果更改后退税的，比如追补扣除的，可以申请退税。
如果是在纳税年度的次年5月31日前更正当年度的汇算申报表，可以在系统中自行撤回，然后更改申报，多缴纳企业所得税的也可以退税，补税的也不需要缴纳滞纳金。