企业虽然拥有高新技术企业证书，但是并不具有直接享受科技型中小企业研发费用100%加计扣除的政策。
因为，16号公告第二条规定，科技型中小企业条件和管理办法按照《科技部 财政部 国家税务总局关于印发〈科技型中小企业评价办法〉的通知》（国科发政〔2017〕115号）执行。也就是说，企业想要享受科技型中小企业研发费用100%加计扣除政策，需要先取得“科技型中小企业”的资格。
企业虽然拥有高新技术企业证书，按照国科发政〔2017〕115号是比较容易就取得“科技型中小企业”的资格，因为国科发政〔2017〕115号第八条规定，符合第六条第（一）～（四）项条件的企业，若同时符合下列条件中的一项，则可直接确认符合科技型中小企业条件：
（一）企业拥有有效期内高新技术企业资格证书；
（二）企业近五年内获得过国家级科技奖励，并在获奖单位中排在前三名；
（三）企业拥有经认定的省部级以上研发机构；
（四）企业近五年内主导制定过国际标准、国家标准或行业标准。
因此，企业在拥有高新技术企业证书后，应按照国科发政〔2017〕115号要求在线填报《科技型中小企业信息表》，经公示后即可取得“科技型中小企业”资格，然后企业就可以按照享受研发费用的100%加计扣除政策了。